El CCPCI está integrado por representantes de la SE: la Subsecretaria de Normatividad y Servicios a la Industria y al Comercio Exterior, quien lo preside; el Jefe de la Unidad de Prácticas Comerciales Internacionales, quien funge como Secretario Técnico, por parte de la Secretaría de Economía también participan el Director General de Industrias Pesadas y Alta Tecnología, el Director General de Industrias Básicas y el Director General de Consultoría Jurídica de Negociaciones. De la SHCP participan funcionarios de la Administración General de Aduanas y la Unidad Política de Ingresos.

La representación del sector privado se integra por 12 miembros designados a propuesta del Consejo Coordinador Empresarial (CCE), en consulta con la Confederación de Cámaras Industriales de los Estados Unidos Mexicanos (CONCAMIN), la Coordinadora Empresarial para el Comercio Exterior (COECE) y el Consejo Mexicano de Comercio Exterior (COMCE).

Adicionalmente, el Secretario de Economía designa a tres integrantes del ámbito profesional o académico.

No obstante la forma como hayan sido designados, los miembros del sector privado y académico participan a título personal, como expertos en la materia, y no llevan una representación institucional.